شرکت نوسازی و عمران اکباتان به تبع اهداف و ماموریتها و گستردگی و تنوع فعالیتها، دارای ساختار قابل انعطاف سازمانی بوده و با گردآوری عوامل انسانی متخصص در بخشهای مختلف، زمینه انجام فعالیتهای اجرائی ـ عمرانی را با راهکارهای مختلف امانی،‌ پیمانکاری، مدیریت پروژه،‌ ارائه خدمات تخصصی و روش های ترکیبی فراهم نموده است. نمودار زیر تاپ چارت سازمانی شرکت نوسازی و عمران اکباتان را نشان می دهد.